Sistemas y Servicios de Salud - (SSS) comprende: Organización y Gestión de los Sistemas y Servicios de Salud; Desarrollo de Recursos Humanos y Tecnogía.
Las funciones de la unidad son: promover, coordinar y ejecutar actividades de cooperación técnica dirigidas a fortalecer la capacidad de los bolivianos en relación con el desarrollo y la organización institucional del sistema de salud y gestión de los servicios de salud que hagan posible y sostenible el acceso universal a la atención de salud de buena calidad.
Su interés está orientado al fortalecimiento de la función rectora del sector sanitario, gestión de los sistemas y servicios de salud, funcionamiento de las actividades sectoriales, vigilancia y evaluación de los procesos de reforma.
Además busca el desarrollo de un enfoque intersectorial para comprender los factores determinantes: sociales, económicos y políticos de la salud de la población; con el fin de promover y propugnar políticas públicas saludables, así como la generación y difusión de conocimientos e información científica - técnica que apoyen las iniciativas de los paises para lograr la salud y el desarrollo humano sostenible.